Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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