Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HLA-DMAP28067 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms