Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sema4fQ9Z123 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema4fQ9Z123 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms