Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GINS2Q9Y248 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS2Q9Y248 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms