Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrfQ9JM73 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms