Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmg20aQ9DC33 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms