Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms