Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdelr2Q9CQM2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms