Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms