Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms