Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnps1Q99M28 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnps1Q99M28 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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