Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q99KU6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q99KU6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q99KU6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q99KU6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q99KU6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms