Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CICQ96RK0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms