Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms