Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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