Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mark1Q8VHJ5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mark1Q8VHJ5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms