Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lin52Q8CD94 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lin52Q8CD94 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lin52Q8CD94 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lin52Q8CD94 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lin52Q8CD94 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lin52Q8CD94 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin52Q8CD94 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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