Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS39

Ccdc32, Coiled-coil domain-containing protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc32Q8BS39 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc32Q8BS39 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms