Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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