Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms