Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg16l2Q6KAU8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms