Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms