Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms