Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d2Q60674 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms