Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd5Q5VCS6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms