Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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D130052B06RikQ3UW13 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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D130052B06RikQ3UW13 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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D130052B06RikQ3UW13 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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D130052B06RikQ3UW13 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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D130052B06RikQ3UW13 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D130052B06RikQ3UW13 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D130052B06RikQ3UW13 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D130052B06RikQ3UW13 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D130052B06RikQ3UW13 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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D130052B06RikQ3UW13 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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D130052B06RikQ3UW13 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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D130052B06RikQ3UW13 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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D130052B06RikQ3UW13 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
D130052B06RikQ3UW13 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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