Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpr55Q3UJF0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms