Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc10Q3TLI0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms