Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde12Q3TIU4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde12Q3TIU4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms