Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sox12Q04890 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox12Q04890 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms