Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms