Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms