Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms