Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms