Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp7P70280 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms