Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhobP62746 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhobP62746 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhobP62746 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhobP62746 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhobP62746 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhobP62746 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhobP62746 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhobP62746 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhobP62746 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhobP62746 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RhobP62746 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RhobP62746 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms