Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms