Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1swP51491 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms