Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa8P50706 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms