Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab17P35292 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms