Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ntf3P20181 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ntf3P20181 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms