Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csn1s1P19228 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms