Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcea1P10711 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms