Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtprqP0C5E4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtprqP0C5E4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtprqP0C5E4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtprqP0C5E4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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PtprqP0C5E4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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PtprqP0C5E4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms