Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfkbieO54910 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfkbieO54910 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms