Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn9O35239 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms