Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BC117090L7N257 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC117090L7N257 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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