Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd1D3YXK1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms