Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms