Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn34dA2AGU5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms